Научно-исследовательская работа - важнейший элемент образовательной программы магистратуры. Ведется в 1-3 семестрах параллельно с теоретическим обучением.
Результаты научно-исследовательской работы обучающихся представляются ежегодно на традиционной секции "Инновационное природопользование" в рамках международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов».